Zastosowania leku w leczeniu epizodów dużej depresji i zapobieganiu nawrotom. Dla osób dorosłych zalecana początkowa dawka wynosi 50 mg dziennie, maksymalna dawka to 200 mg dziennie. W przypadku zapobiegania nawrotom epizodów dużej depresji zaleca się stosowanie tej samej dawki, jak podczas aktualnego epizodu. Leczenie powinno trwać co najmniej 6 miesięcy.
Leczenie zaburzeń obsesyjno-kompulsyjnych u dorosłych oraz dzieci i młodzieży w wieku 6-17 lat. Dla osób dorosłych i młodzieży w wieku 13-17 lat początkowa dawka to 50 mg dziennie, maksymalna dawka to 200 mg dziennie. Dla dzieci w wieku 6-12 lat początkowa dawka to 25 mg dziennie, po 7 dniach można ją zwiększyć do 50 mg dziennie, maksymalna dawka to 200 mg dziennie.
Stosowanie leku w leczeniu lęku napadowego z towarzyszącą agorafobią lub bez niej, zespołu lęku pourazowego, zespołu lęku społecznego. Dla osób dorosłych początkowa dawka to 25 mg dziennie, po 7 dniach zwiększyć do 50 mg dziennie, maksymalna dawka to 200 mg dziennie.

Sertralina może być stosowana w leczeniu różnych stanów, takich jak duże epizody depresji, lęk napadowy z agorafobią, zaburzenia obsesyjno-kompulsyjne u dorosłych i dzieci, zespół lęku społecznego oraz zespół lęku pourazowego, znany również jako PTSD.

Nietolerancja któregokolwiek składnika preparatu, równoczesne stosowanie nieodwracalnych inhibitorów MAO lub pimozydu. Terapię sertraliną można zacząć nie wcześniej niż 14 dni po zakończeniu podawania nieodwracalnych inhibitorów MAO. Przed rozpoczęciem leczenia nieodwracalnym inhibitorem MAO, sertralinę należy odstawić co najmniej na 7 dni.